A região da fronteira entre o Brasil e Peru é considerada uma das mais ricas em biodiversidade do mundo. Para conservá-la, existe hoje um mosaico de aproximadamente 10 milhões de hectares de áreas protegidas que incluem, do lado brasileiro, terras indígenas, Parque Nacional, Parque Estadual, Reserva Extrativista e Estação Ecológica e, do lado peruano, Reservas Territoriais para Povos Indígenas Isolados, Parque Nacional, Comunidades Nativas e Reservas Comunais. Esta região é também conhecida por  sua sociodiversidade. Além de registrar uma das maiores concentrações de povos indígenas isolados do planeta, existem povos, como os Huni Kuĩ, Ashaninka, Jaminawa e Manchineri que vivem em ambos os lados da fronteira. Para completar, destaca-se ainda as populações tradicionais e ribeirinhas, habitantes da Reserva Extrativista Alto Juruá e do Parque Nacional Serra do Divisor.

Entretanto, toda esta riqueza encontra-se hoje fortemente ameaçada em função dos grandes empreendimentos em curso na região decorrentes das políticas e programas de integração binacional. Estes projetos impactam direta e indiretamente as terras indígenas e demais áreas protegidas localizadas na fronteira Brasil-Peru, como é o caso da Estrada do Pacífico/Rodovia Interoceânica, concluída em 2011. Além dos megaprojetos de infraestrutura, outra grande ameaça à região são as concessões para a exploração de recursos naturais (madeira, petróleo, gás natural e outros recursos minerais) cedidas para empresas privadas pelos Governos do Brasil e do Peru.

Para fazer frente a este cenário, desde 2005 a CPI-Acre tem atuado no sentido de promover a troca de informações e o debate sobre as diversas ameaças em curso, como também sobre as experiências bem sucedidas de articulação política e de gestão ambiental entre os povos indígenas e demais populações tradicionais que habitam a faixa de fronteira Brasil-Peru. Nos fóruns coletivos, como o Grupo de Trabalho Transfronteiriço, a CPI-Acre é a instituição que está à frente desta agenda.
As principais ações desenvolvidas no âmbito deste componente são:

• Realização de intercâmbios entre organizações indígenas, indigenistas, ambientalistas, associações agroextrativistas, instituições governamentais e universidades para a troca de experiências relacionadas aos problemas e desafios na faixa de fronteira Brasil-Peru;
• Construção de agendas interinstitucionais em reuniões, seminários temáticos e encontros para discussão de políticas para a proteção dos povos indígenas e da biodiversidade na faixa fronteiriça Brasil-Peru;
• Articulação política junto aos governos do Brasil e Peru, para o nivelamento de informações e formulação de propostas de políticas socioambientais para a região de fronteira;
• Levantamento, monitoramento, sistematização e divulgação de informações por meio do sítio web Observatório Dinâmicas Transfronteiriças;
• Publicação do Informativo Dinâmicas Transfronteiriças Brasil-Peru.

O número de associações e organizações indígenas no Brasil tem aumentado significativamente nos últimos anos em decorrência do volume crescente de programas dos governos federal e estaduais para apoiar projetos indígenas em diversas áreas temáticas. No Acre, atualmente, existem cerca de 40 organizações e associações indígenas, entre associações locais (representantes de aldeias ou terras indígenas), organizações regionais, organizações representativas de categorias profissionais e de gênero.

Entretanto, há organizações indígenas com as quais a CPI-Acre mantém uma relação mais direta, como a Organização de Professores Indígenas do Acre (OPIAC) e a Associação do Movimento dos Agentes Agroflorestais Indígenas do Acre (AMAAIAC), além de outras associações indígenas de base local. Apesar de cada vez mais assumirem a formulação, execução e controle de seus projetos, estas organizações se encontram em diferentes níveis de protagonismo, sendo que muitas delas ainda apresentam fragilidades e demandam assessoria para seu fortalecimento institucional. Neste contexto, a CPI-Acre vem apoiando organizações indígenas em processos que vão desde as discussões iniciais para sua criação e regularização jurídica até a assessoria à concepção, elaboração e gestão de projetos.

As principais ações desenvolvidas no âmbito deste componente são:

• Assessoria à gestão institucional das organizações indígenas;
• Apoio à constituição e regularização jurídica de associações e organizações indígenas;
• Promoção de cursos e oficinas para representantes de organização indígenas na área de gestão institucional e de projetos.